食品流通許可證，是對食品流通許可證的發放、發放條件、發放程序以及與食品衛生許可證的銜接等問題予以明確。2014年10月23日之前，國務院規定對食品經營者必須堅持先證后照，未取得前置審批文件，不得辦理注冊登記手續。2014年10月23日，國務院通過關于取消和調整一批行政審批項目等事項的決定（國發〔2014〕50號），改為后置審批，規定對食品經營者必須先照后證。
己廢止，各地工商管理部門應不再辦理發放新證。2015年11月10日，國家工商行政管理總局發布關于廢止《流通環節食品安全監督管理辦法》和《食品流通許可證管理辦法》的決定（國家工商行政管理總局令第79號），決定廢止《食品流通許可證管理辦法》（2009年7月30日國家工商行政管理總局令第44號）。
要求
（一）申請人應當在申請書上簽字蓋章。新設食品流通經營企業申請許可，該企業的投資人為許可的申請人；已經具有主體資格的企業申請食品經營許可，該企業為申請人；個體工商戶申請食品流通許可，本人為許可的申請人。
（二）申請食品流通許可證所提交的材料，應當真實、有效、符合法定形式。申請人應當對其提交材料的真實性負責。
（三）對于食品流通經營者在2009年6月1日前已經取得《食品衛生許可證》的，原許可證在有效期內繼續有效，自愿申請換證、原許可證載明事項發生變化或者有效期屆滿，食品經營者應當按照《食品流通許可證管理辦法》的規定提出申請，經審核機關審核后，領取食品流通許可證。
辦理條件
（一）申請食品流通許可證，應當提交下列材料：
1.《食品流通許可申請書》；
2.《名稱預先核準通知書》復印件；
3.經營場所合法使用的有關證明；
4.負責人的身份證明；
5.委托書以及委托代理人或者指定代表的身份證明；
6.食品安全管理制度；
7.與其經營活動相適應的食品經營設備清單；
8.提供食品從業人員健康證和衛生法規培訓證復印件；
9.申請乳制品項目的經營者，還應提交開戶行證明和書面聲明等；
10.專職或者兼職食品安全管理人員的身份證明（初中以上學歷證明和培訓合格證明）；
11.工商部門要求提交的其他材料。
（二）已經具有主體資格的經營者在經營項目中申請增加食品流通項目的，需提交營業執照副本原件及復印件，不需提交《名稱預先核準通知書》復印件。對營業執照副本原件當場審驗后退回。
變更
食品經營者注冊公司改變許可事項，應當向原許可機關申請變更食品流通許可。未經許可，不得擅自改變許可事項。 食品經營者向原許可機關申請變更食品流通許可的，應當提交下列申請材料：
食品經營者改變許可事項，應當向原許可機關申請變更食品流通許可。未經許可，不得擅自改變許可事項。
食品經營者向原許可機關申請變更食品流通許可的，應當提交下列申請材料：
（一）《食品流通變更許可申請書》；
（二）《食品流通許可證》正、副本；
（三）與變更食品流通許可事項相關的材料。
食品流通許可的有效期為3年。食品經營者需要延續食品流通許可的有效期的，應當在《食品流通許可證》有效期屆滿三十日前向原許可機關提出申請，換發《食品流通許可證》。
辦理許可證延續的，換發后的《食品流通許可證》編號不變，但發證年份按照實際情況填寫，有效期重新計算。
